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新药研发面临设计难度大,投资大、周期长,失败率高巨大挑战

新药研发通常投入超10亿美元、周期超10年,同时成功率往往不足1/10。

药物分子的设计和芯片的设计一样,难度大,投资大、周期长,失败率高。这些问题长期困扰制药行业,制药业的发展速度无法满足当下人类的各种健康需求,特别是新冠这样的突发疫情,以及癌症、海默症等一直没有特效药的顽症等,都对新药研发非常迫切。

传统的制药模式中,药物结构设计高度依赖专家经验、新药筛选失败率高、药企的投资回报率不断下降等情况使得行业迫切需要变革。


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华为云盘古药物分子大模型,大幅提升药物设计效率

华为云深度联合中国科学院上海药物研究所,

共同训练了华为云盘古药物分子大模型,赋能全流程的AI药物设计。

  • 针对化合物表征学习的全新深度学习网络架构

    华为云盘古药物分子大模型首次采用不对称条件变分自编码器架构,自动找出化合物关键的分子特征指纹,极大提升了下游任务的准确性。

    华为云盘古药物分子大模型首次采用不对称条件变分自编码器架构,自动找出化合物关键的分子特征指纹,极大提升了下游任务的准确性。

  • 进行了超大规模化合物表征模型的训练

    对市面上真实存在的17亿个药物分子的化学结构进行预训练,在化学无监督学习模式下,实现结构重构率、合法性、唯一性等指标全面优于现有方法。

    对市面上真实存在的17亿个药物分子的化学结构进行预训练,在化学无监督学习模式下,实现结构重构率、合法性、唯一性等指标全面优于现有方法。

  • 生成了拥有1亿个新化合物的数据库

    分子生成器生成了1亿个创新的类药物小分子筛选库,其结构新颖性为99.68%,并且可以有效地生成理化性质相似的新化合物,为发现新药创造可能性。此外,基于盘古分子优化器,科研人员实现了对起始分子化学结构的优化,并且能够改善药物分子的特性。

    分子生成器生成了1亿个创新的类药物小分子筛选库,其结构新颖性为99.68%,并且可以有效地生成理化性质相似的新化合物,为发现新药创造可能性。此外,基于盘古分子优化器,科研人员实现了对起始分子化学结构的优化,并且能够改善药物分子的特性。

  • 在20余项药物发现任务上实现性能最优(SOTA)

    在多项任务中取得了领先的预测准确度,包括化合物-靶标相互作用预测、化合物ADME/T属性评分、化合物分子生成与优化等,实现了一个大模型赋能药物发现全链条任务。

    在多项任务中取得了领先的预测准确度,包括化合物-靶标相互作用预测、化合物ADME/T属性评分、化合物分子生成与优化等,实现了一个大模型赋能药物发现全链条任务。

解决方案

华为云联合中国科学院上海药物研究所,共同训练了华为云盘古药物分子大模型。依托华为云一站式医疗研发平台EIHealth,盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构。在药物生成方面,实现了对小分子化合物的独特信息的深度表征、对靶点蛋白质的计算与匹配以及对新分子生化属性的预测,从而高效生成药物新分子;在药物优化方面,实现了对筛选后的先导药进行定向优化。

在实际应用中,华为云联合西安交通大学第一附属医院,基于华为云盘古药物分子大模型研发出全新的广谱抗菌药物,将先导药的研发周期从数年缩短至一个月,华为云盘古药物分子大模型的落地有望革命性地提升新药的研发效率。


中科院上海药物研究所是华为云的战略合作伙伴,我们课题组联合华为云医疗智能体团队共同研发药物领域最大的亿级参数盘古药 物分子大模型。针对分子结构特点,开发出业界独有的图 - 序列非对称自编码器对 17 亿类药分子结构进行预训练。该模型在分子生成、 分子性质预测和分子结构优化相关的 20 多个下游任务中取得了业界最优的性能,实现全流程的 AI 辅助药物设计,大幅缩短药物发 现周期。相信华为云盘古药物分子大模型未来将会为守护人类健康贡献更多的力量。

郑明月中科院上海药物研究所 博导


郑明月
中科院上海药物研究所 博导

中科院上海药物研究所是华为云的战略合作伙伴,我们课题组联合华为云医疗智能体团队共同研发药物领域最大的亿级参数盘古药 物分子大模型。针对分子结构特点,开发出业界独有的图 - 序列非对称自编码器对 17 亿类药分子结构进行预训练。该模型在分子生成、 分子性质预测和分子结构优化相关的 20 多个下游任务中取得了业界最优的性能,实现全流程的 AI 辅助药物设计,大幅缩短药物发 现周期。相信华为云盘古药物分子大模型未来将会为守护人类健康贡献更多的力量。

我们团队研究对抗细菌耐药的新靶标新机制,在早期研 发中验证了细菌组蛋白 Hu 可以作为对抗细菌耐药的靶标。去年我们与华为 云医疗智能体团队一起发布了神农新冠病毒药物筛选平台,有很好的合作基础。今年在华为云盘古药物分子大模型的帮助下,我们 快速找到针对 Hu 蛋白的活性分子,并在小鼠实验中得到验证。华为云盘古药物分子模型使分子毒性降低的同时,提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的广谱抗菌药物,先导药研发周期从数年缩短到一个月。非常感谢华为云医疗智能体团队的支持。 祝华为云盘古药物分子大模型越做越强,更好地服务于企业和科研工作者。

刘冰西安交通大学 蛋白科学与噬菌体研究所所长


刘冰
西安交通大学 蛋白科学与噬菌体研究所所长

我们团队研究对抗细菌耐药的新靶标新机制,在早期研 发中验证了细菌组蛋白 Hu 可以作为对抗细菌耐药的靶标。去年我们与华为 云医疗智能体团队一起发布了神农新冠病毒药物筛选平台,有很好的合作基础。今年在华为云盘古药物分子大模型的帮助下,我们 快速找到针对 Hu 蛋白的活性分子,并在小鼠实验中得到验证。华为云盘古药物分子模型使分子毒性降低的同时,提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的广谱抗菌药物,先导药研发周期从数年缩短到一个月。非常感谢华为云医疗智能体团队的支持。 祝华为云盘古药物分子大模型越做越强,更好地服务于企业和科研工作者。