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创建SFS Turbo - 高性能计算 HPC
S存储中,每个节点直接将NAS挂载到本地盘中,简化安装,使用更加方便。 购买SFS Turbo 1.在华为云控制台搜索“弹性文件服务 SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,
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配置ECS集群互相免密登录 - 高性能计算 HPC
普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建ECS集群,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,添加集群中所有主机的私网IP地址和主机名。 #
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创建弹性云服务器 - 高性能计算 HPC
创建弹性云服务器 弹性云服务器C6h实例介绍 C6h实例为弹性云服务器下的一款裸金属产品,相比于普通的裸金属产品,C6h实例除了提供标准的以太网卡,还提供了一个支持RoCE协议的网卡,而RoCE协议相比于普通的以太协议最大的优势在于时延极低,特别适合HPC场景低时延业务。 购买弹性云服务器
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配置单个ECS免密登录 - 高性能计算 HPC
已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将ECS对应的密钥文件(.pem文件,假设为*.pem)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh $
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创建支持IB网卡的弹性云服务器 - 高性能计算 HPC
文件注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入脚本文件或其他文件。配置文件注入后,系统在创建弹性云服务器时自动将文件注入到指定目录下。 用户数据注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入用户数据。配置用户数据注入后,弹性云服务器首次启动时会自行注入数据信息。
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Intel MPI - 高性能计算 HPC
回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 # mpirun -np 2
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弹性云服务器场景支持使用的MPI - 高性能计算 HPC
弹性云服务器场景支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI
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弹性云服务器场景典型应用 - 高性能计算 HPC
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
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在HPC集群上运行Intel MPI - 高性能计算 HPC
依次登录集群中所有ECS,重复执行1.a~1.c,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行2.a~2.b,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。
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Platform MPI - 高性能计算 HPC
Platform MPI环境变量导入成功 执行下列命令,在单个ECS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 # mpicc hello.c -o platform_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Platform MPI。 # mpirun -np
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创建应用集群 - 高性能计算 HPC
虚拟私有云:集群中的所有弹性云服务器需在同一VPC、同一子网内。 弹性IP:选择暂不购买。 一个集群绑定一个EIP即可。因此,可以在创建应用集群后,再绑定EIP。 购买数量:待创建集群中弹性云服务器的数量。 单击“立即购买”。 在确认规格页面,您可以查看详情并提交申请。 如果确认信息无误,单击“提交订单”。
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在HPC集群上运行Platform MPI - 高性能计算 HPC
该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 关闭防火墙。
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HPC断点续算计算方案 - 高性能计算 HPC
qstat -f 作业ID 如图5所示,作业运行了3分03秒。由此可以看出,作业是从断点的位置进行续算的。 图5 中断后运行作业信息 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
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IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。
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资源和成本规划 - 高性能计算 HPC
6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 8 对象存储服务(OBS) 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。
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制作私有镜像 - 高性能计算 HPC
根据界面提示,填写镜像的基本信息。 源:云服务器 弹性云服务器:保持系统默认值 名称:用户自定义镜像名称。 单击“立即申请”。 系统将自动跳转至镜像服务页面,您可以在此页面查看新创建的私有镜像。 API方式 URI POST /v2/cloudimages/action 请求样例 POST /v2/cloudimages/action
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弹性云服务器场景最佳实践 - 高性能计算 HPC
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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实施步骤 - 高性能计算 HPC
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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附录 - 高性能计算 HPC
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。