该解决方案有何用途?

该解决方案基于开源软件SlurmGearbox构建,快速帮助用户在华为云弹性云服务器 ECS上完成基因测序HPC环境的部署。Slurm是一个开源、容错和高度可扩展的集群管理和作业调度系统,用于大型和小型Linux集群。该方案适用于基因行业的基因测序、数据管理和集群调度等场景。

方案部署架构

该方案可以帮助您在华为云上快速搭建基于开源集群管理和作业调度系统Slurm的基因测序HPC环境。

快速构建基因测序环境

版本:2.0.0

上次更新日期:2023年12月

来源:由华为云构建

部署:预计35分钟

卸载:预计10分钟

数据中心:

架构描述


该方案部署如下资源:


1. 创建三台弹性云服务器 ECS,一台调度节点,两台计算节点。自动部署HPC开源调度软件Slurm,提供基因测序HPC环境。


2. 创建一个弹性文件服务 SFS Turbo(也可使用共享云硬盘 EVS),为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。


3. 创建安全组,可以保护弹性云服务器 ECS的网络安全,通过配置安全组规则,限定云服务器的访问端口。


4. 创建一个弹性公网IP EIP并绑定在管理节点服务器上,用于用户访问基因测序HPC环境。


5. 在调度节点安装Gearbox程序、配置Java环境。


6. 使用云监控服务 CES,Gearbox程序监测集群作业状态,计算自定义指标Workload值,上报指标到云监控服务。

架构描述


该方案部署如下资源:


1. 创建三台弹性云服务器 ECS,一台调度节点,两台计算节点。自动部署HPC开源调度软件Slurm,提供基因测序HPC环境。


2. 创建一个弹性文件服务 SFS Turbo(也可使用共享云硬盘 EVS),为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。


3. 创建安全组,可以保护弹性云服务器的网络安全,通过配置安全组规则,限定云服务器的访问端口。


4. 创建一个弹性公网IP EIP并绑定在管理节点服务器上,用于用户访问基因测序HPC环境。


5. 在调度节点安装Gearbox程序、配置Java环境。


6. 使用云监控服务 CES,Gearbox程序监测集群作业状态,计算自定义指标Workload值,上报指标到云监控服务。

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