基因容器 GCS-gcs sub repjob:注意事项
时间:2025-09-18 09:22:19
注意事项
- 提交多个并行 shell 脚本具体格式如下:
首先准备需要并行的单一脚本 bwa_mem.sh,对 fastq 原始文件,执行 bwa mem 命令,进行基因序列比对。
# cat bwa_mem.sh fastq=$1ref=$2bwa mem $ref $fastq
然后准备调用单一脚本的并行脚本 bwa_mem_work.sh。其中,bwa_mem.sh 可以是相对路径,要求与 bwa_mem_work.sh 在同一路径下,也可以是绝对路径。
- Tools 如果希望调用基因容器服务工具仓库,请在 https://console.huaweicloud.com/gcs/?region=cn-north-1#/app/tools/list,选择需要的软件。软件名称、版本,按照 [软件名称:软件版本] 格式填写即可。
support.huaweicloud.com/clir-gcs/gcs_clir_04_0008.html
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