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在HPC集群上运行MPI应用 - 高性能计算 HPC
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
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创建SFS Turbo - 高性能计算 HPC
创建SFS Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储(NAS),可为云上多个弹性云服务器(Elastic Cloud Server,ECS),容器(CCE&CCI),裸金属服务器(BMS)提供共享访问,能够弹性伸缩至320TB规模,具备高可用性和持久性,
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在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI - 高性能计算 HPC
在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上,运行IB驱动自带的MPI应用(3.0.0rc6版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。
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在HPC集群上运行Platform MPI - 高性能计算 HPC
前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,关闭ECS防火墙。
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实施步骤 - 高性能计算 HPC
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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在HPC集群上运行Intel MPI - 高性能计算 HPC
在HPC集群上运行Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群(以CentOS7.3为例)上运行Intel MPI应用(l_mpi_2018.0.128版本)。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。
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附录 - 高性能计算 HPC
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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方案概述 - 高性能计算 HPC
优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持进行操作,建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。
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主要概念 - 高性能计算 HPC
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
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MPI安装 - 高性能计算 HPC
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-
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常见问题 - 高性能计算 HPC
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
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RoCE - 高性能计算 HPC
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2
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挂载共享目录 - 高性能计算 HPC
设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs 父主题: 实施步骤
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RDMA - 高性能计算 HPC
远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。
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创建HPC私有镜像 - 高性能计算 HPC
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。
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通讯录安装 - 高性能计算 HPC
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
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配置节点互信 - 高性能计算 HPC
配置节点互信 配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如
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RoCE网络问题 - 高性能计算 HPC
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象: dtest/rping打流测试网络双向不通问题:A机器作为Server端,B机器作为Client端,dtest/rping测试RoCE网络异常;调换A、B机器角色,B机器作为Server端,A机器作为Client
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STAR-CCM+部署HPC集群流程图 - 高性能计算 HPC
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
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STAR-CCM+安装与运行 - 高性能计算 HPC
Linux系统可以通过查询/proc/cpuinfo文件得到和cpu相关的信息,所需要参数解释如下: cat /proc/cpuinfo physical id:【处理器个数】物理cpu序列(最大序列为物理cpu数+1) core id:【cpu物理核数】物理核数序列(最大序列为物理核数