华为云计算 云知识 什么是Miniasm

什么是Miniasm

简介

Miniasm是由李恒开发,适合于小基因组及重复序列比例低的基因组组装,相对于Canu和Falcon软件,Miniasm组装速度非常快。建议通过git下载最新版本。

配置流程

1.配置编译环境

1)安装wget工具。

yum install wget-y

2)安装miniasm依赖库和工具

yum install-y git gcc-c++zlib*-y

----结束

2.获取源码

获取“miniasm”源码包。

cd/usr/local/src
git clone https://github.com/lh3/miniasm

3.编译和安装

编译miniasm

cd/usr/local/src/miniasm
make

4.运行和验证

查看miniasm的版本信息。

cd/usr/local/src/miniasm
./miniasm-V

回显内容如下,表示安装成功。

0.3-r179


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