Oases是什么_Oases如何配置-华为云

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什么是Oases

时间: 2020-11-03 11:11:49

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简介

Oases是一个转录组组装器，旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本。

1.配置编译环境

安装相关依赖。

yum install-y git

2.获取源码

获取“oases”源码包。

cd/usr/local
git clone--recursive https://github.com/dzerbino/oases

3.编译和安装

1）修改Makefile文件，将“/usr/local/oases/velvet/Makefile”CFLAG后面的“-m64”删除。

修改前。

CFLAGS=-Wall-m64

修改后。

CFLAGS=-Wall

2）编译Oases。

make-j4

编译完成后会在oases目录下生成可执行程序oases。

3）设置软连接。

ln-s/usr/local/oases/oases/usr/bin/oases

4.运行和验证

查看Oases版本信息。

oases--version

回显如下信息则表示Osaes安装成功。

oases 0.2.09