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randfold是什么

时间: 2020-11-03 14:06:59

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简介

randfold是一个独立的基因测序相关软件，它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能（MFE），并多次重复计算以建立最小自由能（MFE）值的分布。

1.配置编译环境

安装依赖。

yum install-y git

2.获取源码

获取“randfold”源码包。

cd/usr/local/
git clone https://github.com/eb00/randfold.git

3.编译和安装

1）编译randfold。

cd randfold/src/squid-1.9g
./configure&&make

2）编译randfold。

cd../
make

编译完成后会生成可执行文件“randfold”。

3）设置软连接。

ln-s/usr/local/randfold/src/randfold/usr/bin/randfold

4.运行和验证

执行如下测试命令。

randfold-d let7.tfa 999

当系统回显类似如下信息是，表示randfold执行成功。

cel-let-7-42.90 0.001000