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云知识 SnpEff如何配置 SnpEff如何配置 时间:2020-11-03 14:31:58 简介 SnpEff是一款常用的突变位点注释工具。这款软件基于Java语言开发,安装过程相对简单,下载后解压缩即可使用。 配置流程 1.配置编译环境 1)安装JDK1.8。 yum install-y来自:百科本文选用华为鲲鹏云服务E CS KC1实例做测试 2.配置编译工具 1)编译TinyXML需要g++编译器因此需要安装g++。 yum install gcc-c++ -y 2)获取源代码。 3)执行以下命令,获取TinyXML软件包。 wget https://github.com/l来自:百科
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分析。 配置流程 1. 配置编译环境 安装相关依赖。 yum install zlib-devel bzip2-devel xz-devel -y 2. 获取源码 获取“bedtools-2.28.0”源码包。 cd /usr/local wget https://github.来自:百科StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。 cd/usr/local/ wget https://github.com/gperte来自:百科
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