华为云计算 云知识 MISO是什么意思
MISO是什么意思

简介

MISO(同工型混合物)是一种概率框架,可从RNA-Seq数据中定量分析可变剪接基因的表达水平,并鉴定样品中差异调控的同工型或外显子。通过从RNA-Seq中的同工型产生读数的生成过程进行建模,MISO模型使用贝叶斯推断来计算读数源自同工型的可能性。

配置流程

1.配置编译环境

安装相关依赖。

yum install gcc gcc-c++gcc-gfortran python36 python36-devel python36-numpy python36-numpy-f2py libjpeg-turbo-devel freetype-devel bzip2 bzip2-devel libpng libpng-devel openblas openblas-devel xz xz-devel-y

2.编译和安装

安装misopy。

pip3 install misopy

3.运行和验证

1)查看python模块安装列表。

pip3 list
cycler(0.10.0)
kiwisolver(1.2.0)
matplotlib(3.2.1)
misopy(0.5.4)

2)Python中引入misopy模块使用。

python3
import misopy as mis
print(mis.__version__)

打印出如下信息,说明misopy可以正常使用。

0.5.4

 

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