miRanda是什么
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简介
miRanda是一种用于寻找microRNA基因组标靶的算法。该算法有C语言编写，可视作GPL下的开源方法使用。
配置流程
1.配置编译环境
安装wget。
yum install wget-y
2.获取源码
获取“miRanda-v3.3a”源码包。
cd/usr/local/ wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz
3.编译和安装
1）解压并进入源码包。
tar-zxvf miRanda-aug2010.tar.gz cd miRanda-3.3a
2）生成Makefile文件。
./configure--prefix=/usr/local/miranda--build=arm
3）编译安装miRanda。
make-j4&&make install
4）设置软连接。
In-s/usr/local/miranda/bin/miranda/usr/bin/miranda
4.运行和验证
查看miRanda版本信息。
miranda--version
当系统回显类似如下信息时，表示miranda安装成功执行成功。
=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= miranda v3.3a micriRNA Target Scanning Algorithm =-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= (c)2003 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center,New York Authors:Anton Enright,Bino John,Chris Sander and Debora Marks (mirnatargets(at)cbio.mskcc.org-reaches-all authors)
