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云知识 SnpEff如何配置 SnpEff如何配置 时间：2020-11-03 14:31:58 简介 SnpEff是一款常用的突变位点注释工具。这款软件基于Java语言开发，安装过程相对简单，下载后解压缩即可使用。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装JDK1.8。 yum install-y来自：百科![]()
再次保存。 编译和测试方式 1.选择操作环境 本文选用华为鲲鹏云服务E CS KC1实例做测试 2.配置编译工具 1)编译TinyXML需要g++编译器因此需要安装g++。 yum install gcc-c++ -y 2)获取源代码。 3)执行以下命令，获取TinyXML软件包。来自：百科![]()
对简单的任务（例如，将两个间隔文件相交），但可以通过在UNIX命令行上组合多个bedtools操作来进行相当复杂的分析。 配置流程 1. 配置编译环境 安装相关依赖。 yum install zlib-devel bzip2-devel xz-devel -y 2. 获取源码 获取“bedtools-2来自：百科![]()
基因，可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）专用软件来处理StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。来自：百科![]()
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