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    的序列上比对。BWA-MEM相比较BWA-backtrack在70-100bp illumina reads上有更好的性能。。它由三个不同的算法: BWA-backtrack:是用来比对Illumina的序列的,reads长度最长能到100bp。- BWA-SW:用于比对long
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    或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列。 BLAST是基于Altschul等人在J.Mol.Biol上发表的方法(J.Mol.Biol.215:403-410(1990)),在序列数据库中对查询序列进行同源性比对工作。从最初的BLAST发展到现在NCBI提供的BLAST2
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