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云知识 SnpEff如何配置 SnpEff如何配置 时间:2020-11-03 14:31:58 简介 SnpEff是一款常用的突变位点注释工具。这款软件基于Java语言开发,安装过程相对简单,下载后解压缩即可使用。 配置流程 1.配置编译环境 1)安装JDK1.8。 yum install-y来自:百科华为云计算 云知识 TinyXML如何配置 TinyXML如何配置 时间:2020-11-16 14:21:43 简介 TinyXML是一个简单,小巧的C++XML解析器,可以轻松集成到其他程序中。它读取XML并创建表示XML文档的C++对象。可以将对象作为XML进行操作,更改和再次保存。来自:百科
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中: a. cpg.bed:人类基因组中的CpG岛。 b. exons.bed:人类基因的RefSeq外显子。 c. gwas.bed:在全基因组关联研究(GWAS)中鉴定的与人类疾病相关的SNP。 2)获取交集信息。 比如,找到A和B文件中重叠的部分。 bedtools intersect来自:百科基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)专用软件来处理StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。来自:百科
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