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- gcs基因容器 内容精选 换一换
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查看任务信息。gcs get executionEXECUTIONID [params]execution可以简写为exec，即：gcs get execEXECUTIONID [params]可以直接执行 gcs get execution，显示所有任务情况。也可以 gcs get execution executionID 指定显示单来自：帮助中心下载kubetcl命令行工具，并进行相关配置。gcs get kubectlkubectl可以简写为kube，即：gcs get kube无执行本命令前请先删除当前目录下当前目录下 kubectl* 相关文件及目录。命令执行完成后，根据使用场景，按需切换kubectl的访问模式。VPC网络内接入访问请执行此命令。kubectl confi来自：帮助中心
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获取默认环境下对应的sfs pvc name列表。gcs get sfs无无返回值：来自：帮助中心终止指定的WDL流程。gcs set wdl ID[flags]终止指定流程。返回内容如下。来自：帮助中心
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G CS _SFS_PVC 变量GCS_SFS_PVC用于代表GCS环境的SFS文件存储卷，便于挂载常用的SFS文件存储卷。 GCS_SFS_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: gensfs: mount_path:来自：帮助中心![]()
利用FILENAME参数提供的流程文件直接创建execution。提示：该命令行不会新建workflow模板。如果已经有workflow模板，推荐直接使用gcs create exection。gcs sub workflow FILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs sub wf FILENAME来自：帮助中心![]()
查看模板信息。gcs del workflowWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]workflow可以简写为wf，即：gcs del wfWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]删除workflow 之前，需要删除所有引用该workflow 的 executi来自：帮助中心![]()
GCS_DATA_PVC 变量GCS_DATA_PVC用于代表每个环境关联的 OBS 桶，便于挂载常用的对象存储桶。 GCS_DATA_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: genobs: mount_path: /obs来自：帮助中心![]()
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指定需要创建的模板名称，上传新的模板。同名模板上传两次会报错。gcs create workflowFILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs create wf WORKFLOWID [params]创建 workflow。这里以 GATK 流程为例，首先，依据 流程语法说明，编写 YAML 文件。来自：帮助中心![]()
GCS_REF_PVC 变量GCS_REF_PVC用于代表GCS提供的共享存储PVC，便于挂载存储。 GCS_REF_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: genref: mount_path: /ref #挂载到容器内的路径来自：帮助中心![]()
创建execution。gcs create execution WORKFLOWID [params]execution可以简写为exec，即：gcs create exec WORKFLOWID [params]该命令的输入参数是 workflowID，可以通过 gcs get worflowID 查询后，根据name/versi来自：帮助中心![]()
查看workflow信息。gcs get workflow WORKFLOWID [params]workflow可以简写为wf，即：gcs get wf WORKFLOWID [params]获取所有模板信息。gcs get workflow workflow_id name来自：帮助中心![]()
更新流程的相关信息。目前命令行只支持更改描述信息以及流程文件（已经使用中的流程不能更改流程文件）gcs update workflowworkflow-id [params]workflow可以简写为wf，即：gcs update wfworkflow-id [params]更新某个流程的描述信息来自：帮助中心
