gcs基因容器_gcs 云服务器-华为云

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gcs基因容器内容精选换一换
使用命令行工具执行测序

下载并配置G CS 命令行工具，方法请参见安装命令行工具。使用命令行工具查询环境。执行./gcs get environment 查看当前账号下可用的环境列表：设置环境。执行./gcs set env设置后续测序使用的环境： ./gcs set env gcs-env-cc

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金橡医学

，从而帮助基因测序企业实现提高基因检测的效率和质量。华为云基因容器服务（GCS），是业界首个基于Kubernetes平台，结合Docker容器技术打造的基因测序云服务。相对行业中传统使用的HPC高性能计算集群，基因容器服务有着明显的领先优势：资源调度更灵活计算可以按需伸缩任务流程方便自定义

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gcs基因容器相关内容
策略及授权项说明

chive gcs:workflows:download obs:object:GetObject √ √ 创建tool POST /v1/tools gcs:tools:create - √ √ 查询tool GET /v1/tools/{tool_id} gcs:tools:get

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gcs get sfs

获取默认环境下对应的sfs pvc name列表。gcs get sfs无无返回值：

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gcs基因容器更多内容
gcs sub repjob

提交一组并行的 shell 脚本，作为多个 job 在后台执行。gcs sub repjob FILENAME [params]rejob可以简写为rjb，即：gcs sub rjb FILENAME [params]提交多个并行 shell 脚本具体格式如下：首先准备需要并行的单一脚本 bwa_mem.sh，对 fastq 原始文件

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gcs get kubectl

下载kubetcl命令行工具，并进行相关配置。gcs get kubectlkubectl可以简写为kube，即：gcs get kube无执行本命令前请先删除当前目录下当前目录下 kubectl* 相关文件及目录。命令执行完成后，根据使用场景，按需切换kubectl的访问模式。VPC网络内接入访问请执行此命令。kubectl confi

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gcs version

查看命令行工具的软件版本以及编译平台。gcs versionversion可以简写为ver，即：gcs ver查看软件版本：示例执行结果：

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gcs get execution

查看任务信息。gcs get executionEXECUTIONID [params]execution可以简写为exec，即：gcs get execEXECUTIONID [params]可以直接执行 gcs get execution，显示所有任务情况。也可以 gcs get execution executionID 指定显示单

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gcs 命令详情

华为云帮助中心，为用户提供产品简介、价格说明、购买指南、用户指南、API参考、最佳实践、常见问题、视频帮助等技术文档，帮助您快速上手使用华为云服务。

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gcs set wdl

终止指定的WDL流程。gcs set wdl ID[flags]终止指定流程。返回内容如下。

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华为云全球首发基因容器推动基因计算迈入新纪元

了解华为云新闻报道华为云全球首发基因容器推动基因计算迈入新纪元新闻报道华为云全球首发基因容器推动基因计算迈入新纪元 2018-10-18 10月11日，在2018华为全联接大会上，华为云全球首家推出了以kubernetes为基础的基因容器服务。基因容器将基因测序和容器技术这两个

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gcs sub workflow

利用FILENAME参数提供的流程文件直接创建execution。提示：该命令行不会新建workflow模板。如果已经有workflow模板，推荐直接使用gcs create exection。gcs sub workflow FILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs sub wf FILENAME

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gcs del workflow

查看模板信息。gcs del workflowWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]workflow可以简写为wf，即：gcs del wfWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]删除workflow 之前，需要删除所有引用该workflow 的 executi

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云容器引擎环境

云容器引擎是由一系列弹性云服务器组成的一个Kubernetes集群，基因容器所有执行的分析流程都会运行在这个集群中。如果您对集群并不了解，请查看集群概述，了解集群概念、集群和虚拟私云及子网间关系、集群和节点的使用约束。创建环境开始基因分析前，请先创建环境。登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”，在右侧页面单击“创建环境”。

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gcs get workflow

查看workflow信息。gcs get workflow WORKFLOWID [params]workflow可以简写为wf，即：gcs get wf WORKFLOWID [params]获取所有模板信息。gcs get workflow workflow_id name

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gcs create execution

创建execution。gcs create execution WORKFLOWID [params]execution可以简写为exec，即：gcs create exec WORKFLOWID [params]该命令的输入参数是 workflowID，可以通过 gcs get worflowID 查询后，根据name/versi

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GCS流程执行

华为云帮助中心，为用户提供产品简介、价格说明、购买指南、用户指南、API参考、最佳实践、常见问题、视频帮助等技术文档，帮助您快速上手使用华为云服务。

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gcs update workflow

更新流程的相关信息。目前命令行只支持更改描述信息以及流程文件（已经使用中的流程不能更改流程文件）gcs update workflowworkflow-id [params]workflow可以简写为wf，即：gcs update wfworkflow-id [params]更新某个流程的描述信息

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gcs get obscli

下载obs 命令行工具，并进行相关配置。语法 gcs get obscli obscli可以简写为obs，即： gcs get obs 参数说明无注意事项执行本命令前请先删除当前目录下obs* 相关文件及目录。使用示例 gcs get obscli 返回值： start download

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【智行100】华为云助力华大基因突破算力瓶颈，让基因测序更快更稳更准

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makingcss 一个提高CSS编写效率的网站

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