gcs基因容器_基因组浏览器-华为云

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gcs基因容器内容精选换一换
万万没想到，云原生基础设施还能加速农作物基因测序

本文介绍了【万万没想到，云原生基础设施还能加速农作物基因测序】相关内容，与您搜索的gcs基因容器相关，助力开发者获取技术信息和云计算技术生态圈动态...请点击查阅更多详情。

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gcs get obscli

下载obs 命令行工具，并进行相关配置。语法 gcs get obscli obscli可以简写为obs，即： gcs get obs 参数说明无注意事项执行本命令前请先删除当前目录下obs* 相关文件及目录。使用示例 gcs get obscli 返回值： start download

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gcs基因容器相关内容
gcs create workflow

指定需要创建的模板名称，上传新的模板。同名模板上传两次会报错。gcs create workflowFILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs create wf WORKFLOWID [params]创建 workflow。这里以 GATK 流程为例，首先，依据流程语法说明，编写 YAML 文件。

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GCS自定义策略

"Action": [ "gcs:workflows:create", "gcs:workflows:list", "gcs:executions:create" ]

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gcs基因容器更多内容
查询tool列表

"domain": "gcs_container", "domain_id": "024014b87********30fbe790bda3e6", "vendor": "基因容器团队", "image":

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初始化GCS对象

G CS Client()创建GCSClient实例。向GCS发送任一请求之前，必须先创建一个GCSClient实例。初始化的实例中参数值为空，需要通过用户名/密码方式初始化入参或AK/SK方式初始化入参初始化入参，然后才能通过实例调用GCS提供的其它接口。无返回一个GCSClient实例，通过该实例调用GCS提供的接口。

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流程设计器

流程设计器基因容器的流程中至少有一个工具，流程中每个工具会根据它们的先后顺序形成数据流，前一个工具会为后一个工具提供输入。基因容器的流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器，您可以拖拽工具到画布中，可视化连接各工具，指定工具间的先后顺序。不管您是

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基于GCS构建基因测序平台

测序平台：面向用户提供测序服务，通过调用GCS的API响应用户的测序需求。当用户想发起测序请求时，调用GCS的API执行测序，待测序完成后获取测序结果并返回给用户。 GCS服务：提供底层测序API共测序平台调用。从上面的描述可以看出，测序平台相当于用户与GCS之间的一个代理，将用户的测序请求转发给GCS处理，然

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华为云容器和微服务是什么

本文介绍了【华为云容器和微服务是什么】相关内容，与您搜索的gcs基因容器相关，助力开发者获取技术信息和云计算技术生态圈动态...请点击查阅更多详情。

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与其它云服务的关系

与其它云服务的关系基因容器服务与华为云其它服务的关系如图1所示。图1 基因容器与华为云服务的关系云容器引擎（CCE）基因容器使用的底层资源均由CCE服务创建。云容器引擎（Cloud Container Engine）提供高可靠高性能的企业级容器应用管理服务，支持Kuber

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ouputs

ouputs 可选项，用于定义数据处理流程完成后，最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示，此外，为了让您更直观的查看结果文件，基因容器集成 IGV（IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/）软件，您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。

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产品优势

产品优势基因容器基于Kubernetes智能化基因计算任务调度和Spark等加速服务，为您提供低成本高性能的基因测序解决方案。支持对接深度学习框架，方便您深度解读报告。秒级并发基因容器利用容器技术的秒级并发能力，可将WGS从30小时缩短至5小时以内，对比同类竞品，使用相同样本的情况下，资源利用率大幅提升。

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云容器实例环境

清理环境为了防止您为不需要的服务付费，建议您使用完成后清理环境。环境清理后基因容器服务将不再使用该命名空间，命名空间还将为您保留。如默认环境被清理，则最新创建的环境会自动变成默认环境。登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”。单击“云容器实例”页签，在需要清理的环境中单击“清理环境”。

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错误码

400 GCS.4006004 Bad request, tool not exist. 请求错误，请求的tool不存在 400 GCS.4006007 Bad request, request body is invalidate. 请求错误，请求体非法 400 GCS.4006009

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数字化转型“军舰”启航：详解华为云容器全新解决方案

本文介绍了【数字化转型“军舰”启航：详解华为云容器全新解决方案】相关内容，与您搜索的gcs基因容器相关，助力开发者获取技术信息和云计算技术生态圈动态...请点击查阅更多详情。

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委托权限

权servicestage的同时也会授权GCS，反之亦然。为解决该问题，GCS服务提供了新的委托方式，后续若您不再使用GCS服务，可直接删除委托“gcs_admin_trust”，该操作将只影响GCS，不影响您使用其他服务。由于GCS在运行中对存储、容器等各类云服务资源都存在

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基于CCE的GATK4最佳实践流程

ttps://GCS_ENDPOINT”。 export GCS_Endpoint="https://gcs.cn-north-4.myhuaweicloud.com" 创建环境。调用5.1.1-部署Environment接口，利用前提条件中已创建的集群创建GCS环境。 curl

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今天你“云原生”了吗？

本文介绍了【今天你“云原生”了吗？】相关内容，与您搜索的gcs基因容器相关，助力开发者获取技术信息和云计算技术生态圈动态...请点击查阅更多详情。

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必选控制策略

"obs:*::bucket:rgcservice-managed-*-logs-*" ], "Condition": { "StringNotMatch": { "g:PrincipalUrn": "sts::*:assumed-agency:RGCServiceExecutionAgency/*"

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内置变量

内置变量 item GCS_REF_PVC GCS_DATA_PVC GCS_SFS_PVC

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复杂依赖任务（DAG）

type: GCS.Job resources: memory: 1g cpu: 0.5c commands: - echo "A" b: tool: bwa:0.7.12 type: GCS.Job

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