虚拟药物筛选-华为云

医疗智能体 EIHEALTH-获取study作业的最值信息:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/studies/{study_id}/jobs/{job_id}/extremum 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 study_id 是 String study_id 最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String study作业id 最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHEALTH 虚拟药物筛选

医疗智能体 EIHEALTH-获取study作业的最值信息:响应参数

响应参数状态码： 200 表3 响应Body参数参数参数类型描述 maximum ExtremumDto object study作业最值信息 minimum ExtremumDto object study作业最值信息表4 ExtremumDto 参数参数类型描述 value Double 最值 row_number Long 最值所在的行数 column_name String 最值所在的列名 row_name String 最值所在的行名

医疗智能体 EIHEALTH 虚拟药物筛选

医疗智能体 EIHEALTH-获取study作业的最值信息:响应示例

响应示例状态码： 200 OK { "maximum" : { "value" : 17, "row_number" : 102, "column_name" : "Mpro", "row_name" : "AZD-5991" }, "minimum" : { "value" : 17, "row_number" : 102, "column_name" : "Mpro", "row_name" : "AZD-5991" } }

医疗智能体 EIHEALTH 虚拟药物筛选

医疗智能体 EIHEALTH-获取生成study作业3D结构的内容:URI

URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/studies/{study_id}/jobs/{job_id}/3d-structure 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128 study_id 是 String study_id 最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String study作业id 最小长度：1 最大长度：128 表2 Query参数参数是否必选参数类型描述 ligand 是 String 配体名称最小长度：1 最大长度：200 receptor 是 String 受体名称最小长度：1 最大长度：200

医疗智能体 EIHEALTH 虚拟药物筛选

医疗智能体 EIHealth-删除study:URI

URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/studies/{study_id} 表1 路径参数参数是否必选参数类型描述 eihealth_project_id 是 String 医疗智能体平台项目ID，您可以在EIHealth平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看“项目编号”“项目编号”。最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 study_id 是 String study_id 最小长度：1 最大长度：128

医疗智能体 EIHealth 虚拟药物筛选

医疗智能体 EIHealth-创建虚拟药物筛选任务:创建药物虚拟筛选任务

创建药物虚拟筛选任务虚拟药物筛选可以使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。使用步骤如下所示。登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“Docking Summary”流程至所需的项目中。进入“专题”页签，单击“新建研究”。图1 新建研究填写任务的基本信息，包括选择任务所属项目，研究的名称和描述。图2 基本信息选择配体分子和受体蛋白。作业名称：自定义名称。类型：选择小分子化合物。流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。配体分子：配体分子文件，支持SMILES、SD SDF、PDBQT格式。受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB、PDBQT格式。图3 选择配体分子和受体蛋白设置数据库。数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。数据库模板：使用资产市场订阅的流程时，模板已预置，无需选择数据库模板。数据库名称：数据库的名称。输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时，保存格式为.txt。相对路径：流程运行完成后，会按照流程子任务的名称生成数据文件，相对路径指按照哪个数据路径中的结果文件生成数据库。对于“Docking Summary”流程，包含5个子任务，默认在task-5-docking summary中保存有汇总的数据文件。 task-1-ligand 3dsdf to pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。 task-5-docking summary：汇总分子对接结果。图4 数据路径和流程图图5 设置数据库设置完成后，单击“提交”，执行药物虚拟筛选任务。对于“运行中”的任务，允许取消、强制停止或删除。图6 运行状态

医疗智能体 EIHealth 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选

云服务器内容精选

虚拟药物筛选

7*24

备案

专业服务

退订

建议反馈

售前咨询热线