医疗智能体 EIHEALTH-合成路径规划
时间:2024-01-23 20:15:38
合成路径规划
合成路径规划基于盘古药物分子大模型,根据给定的目标分子,可以设计出完整且合理的合成路径。
- 单击“立即使用”,进入配置页面。
- 在配置页面,可以在左侧绘制分子,也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。
- 上传分子文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。
- 最大搜索路径个数:合成路径规划的路径数量。路径数量增加,将展示更多的合理合成路径;路径数量减少,可能会有部分合理路径未展示。默认值50,取值范围1-50。
- 最大搜索深度:深度增加,每一个路径可进行搜索的深度限制增加,作业运行时间可能延长;深度减少,部分路径可能在还未搜索完成时被终止。默认值5,取值范围3-12。
- 最大搜索时间:合成路径规划的搜索时间限制,到达限制时间会返回已经搜索完成的路径。搜索时间增加,作业运行时间延长;搜索时间减少,可能会有部分合理路径未能开始搜索。默认值30min,取值范围5-60。
- 每个产物最大反应数量:合成路径中每一个中间产物最多有多少种可能的反应,按照反应置信度从高到低排序。最大反应数量增加,每个中间产物的可搜索反应范围数量增加,作业运行时间延长;最大反应数量减少,可能会有部分合理反应未能纳入搜索。默认20,取值范围2-20。
- 作业名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。
- 标签:设置作业标签。
- 功能调用次数:合成路径规划目前是一个运行成功得作业消耗一次功能调用次数。
图1 分子合成路径
引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。
- 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。
- 单击查看路径,查看输出结果详情。
下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。
图3 查看运行结果(2)
父主题: 功能模块
support.huaweicloud.com/usermanual-eihealth/eihealth_38_0031.html
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