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    17:16:12 简介 StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)专用软件来处理StringTie的输出。
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    它是基于Python Web框架Django实现的。通过使用Hue可以通过浏览器方式操纵Hadoop集群。例如put、get、执行MapReduce Job等等。 配置流程 1.配置编译环境 1)安装Hue依赖工具和库。 sudo yum-y install libffi-devel
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    5碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等。它适合的工作是将小序列对比至大基因组上去。它最长能读取1024个碱基的片段。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install gcc gcc-c++zlib-devel-y
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