云数据库 RDS for MySQL
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  • ssDB驱动程序安装。 帮助文档 GaussDB 驱动程序安装 GaussDB数据库 开发设计建议 基于JDBC开发 JDBC包 从发布包中获取。包名为GaussDB-Kernel_数据库版本号_操作系统版本号_64bit_Jdbc.tar.gz。解压后JDBC的驱动jar包: gsjdbc4
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    CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar:$JAVA_HOME/lib/junit-4.12.jar:$JAVA_HOME/lib/hamcrest-core-1.3.jar:$CLASSPATH export PATH
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    /lib/zookeeper-3.4.5.jar:/usr/local/canal/bin/../lib/zkclient-0.10.jar:/usr/local/canal/bin/../lib/spring-tx-3.2.18.RELEASE.jar:/usr/local/canal/bin/
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    gatk.jar”文件。 4.运行和验证 测试GATK是否安装完成。 java-jar build/lib/gatk.jar--version 返回内容如下所示,表示安装已经完成。 [root ecs gatk]#java-jar build/lib/gatk.jar--version
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    运行和验证 查看jar包执行参数。 cd varscan java-jar VarScan.v2.4.1.jar 出现类似如下回显表示VarScan2可正常使用。 VarScan v2.4 ***NON-COMMERCLAL VERSION*** USAGE:java-jar VarScan
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    用户可以基于Spark的API进行二次开发,构建自定义Jar包并提交到 CS 集群上运行,CS完全兼容开源社区接口。 创建Spark自定义作业的前提条件: 确保已创建运行自定义作业所需的CS独享集群 确保在构建应用Jar包时,将Spark的相关依赖排除 确保已将自定义Jar包上传到 OBS 桶中 确保已创建DIS的输入输出通道并配置了转储任务
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    1)下载数据。 cd snpEff java-jar snpEff.jar download GRCh38.86 执行完毕后会在当前目录下生成一个“data/GRCh38.86”目录。 2)进行注释。 java-Xmx4G-jar snpEff.jar GRCh38.86 examples/test
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    编译完成后会在“build/libs”目录里面生成“picard.jar”文件。 4.运行和验证 执行以下命令行查看Picard所包含的所有工具以及对应的简介。 java-jar build/lib/picard.jar-h 执行完毕后会回显类似如下信息: USAGE:PicardCommandLine[-h]
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    基本使用 可以GIT下载最新的soot jar包,我下载的是4.1.0版本中的sootclasses-trunk-jar-with-dependencies.jar 包,这个包应该自带了soot所需要的所有依赖。下载完成后使用powershell进入jar文件所在的文件夹,可以输入以下命令:
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