ROMs是什么

2020-11-05 09:55:45

ROMs(Regional Ocean Modeling System)是海洋研究机构常用的区域和大洋环流模式,已经在CO-OPS开始得到大量使用,并且将其列为业务化海洋模式之一。R OMS 模式采用F90/F95编写,代码结构依据网格特点编写,支持共享存储和消息传递两种多处理器体系架构,其对集群性能要求较高,具有计算密集、IO读写量较大、网络延迟带宽要求高的特点。

什么是FVCOM

2020-11-05 09:40:36

FVCOM是无结构三角形网格架构、有限体积、自由表面、三维原始方程海洋数值模型,包含了多种物理、水质、生态计算模块。FVCOM模型输入输出基于标准化NETCDF格式,具有平台通用兼容性,并能使用VISIT可视化软件是输入输出结构进行快速二维/三维可视化。

CMAQ是什么

2020-11-05 09:31:54

CMAQ(Community Multiscale Air Quality通用多尺度空气质量)模型,是美国环保局开发的第三代空气质量预报和评估系统(Models-3)的核心组成之一

什么是SAMtools

2020-11-04 17:41:02

SAMtools是一组实用程序,用于与Heng Li编写的SAM,BAM和C RAM 格式的短DNA序列读取比对进行交互并进行后处理。这些文件是由短读取对齐器(如BWA)作为输出生成的。提供了简单和高级工具,支持复杂任务,例如变体调用和对齐查看以及分类、索引、数据提取和格式转换。

如何配置StringTie

2020-11-04 17:16:12

StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)专用软件来处理StringTie的输出。

HTSeq是什么

2020-11-04 17:13:59

HTSeq是使用Python编写的一支用于进行基因Count表达量分析的软件,能根据SAM/BAM比对结果文件和基因结构注释GTF文件得到基因水平的Counts表达量。HTSeq进行Counts计算的原理简单易懂,容易上手。

gvcftools是什么

2020-11-04 16:53:03

gvcftools是用于创建和分析gVCF文件的小型实用程序包

什么是GATK?

2020-11-04 16:48:09

GATK全称Genome Anlysis Toolkit,是一套用于分析基因组的工具箱。主要功能是寻找变异位点和基因分型,用于从sequencing数据中进行variant calling,包括SNP、INDEL。

BreakDancer是什么

2020-11-04 16:34:11

BreakDancer是一个C++软件包,可提供下一代配对末端测序读取的全基因组结构变异检测。它包括两个补充程序,BreakDancerMax预测五种类型的结构变异;BreakDancerMini专注于使用正态映射的读取对检测小插入缺失。

bedtools如何配置

2020-11-04 16:24:00

bedtools实用程序是用于处理基因组信息分析的强大工具集合。例如,bedtools允许人们以广泛使用的基因组文件格式( 例如BAM,BED,GFF/ GTF,VCF)与多个文件中的基因组间隔相交,合并,计数,互补和混洗。虽然每个工具都设计为执行相对简单的任务(例如,将两个间隔文件相交),但可以通过在UNIX命令行上组合多个bedtools操作来进行相当复杂的分析。

BCFtools是什么

2020-11-04 15:59:12

BCFtools是一组实用程序,以Variant Call Format(VCF)及其二进制副本BCF处理变量调用。所有命令都可以与未压缩和BGZF压缩的VCF和BCF透明地一起使用。

文字识别服务使用视频教程

2020-11-04 15:39:36

本视频主要为您介绍华为云 文字识别 服务如何开通服务、获取访问密钥以及使用SDK的操作视频教程:场景描述:华为云文字识别服务以Restful API的方式提供给用户使用。用户需要申请开通后,才能使用文字识别服务。

NAT网关使用SNAT访问公网操作视频教程

2020-11-04 15:32:56

本视频主要为你介绍华为云NTA网关服务使用SNAT访问公网的操作视频教程: 场景描述: NTA网关能够为 虚拟私有云 内的云主机提供 网络地址转换 服务,使多个主机可以共享 弹性公网IP 访问Internet。 当VPC内的云主机需要访问公网,为了节省弹性 公网IP 资源,并且为避免云主机IP直接暴露在公网上,您可以使用NTA网关的SNAT功能。 云NTA网关服务使用SNAT访问公网操作步骤

IoT云服务设备在线调试指导视频教程

2020-11-04 15:22:40

本视频主要为您介绍IoT 云服务 中设备在线调试指导的操作视频教程:通过实操教程,让您快速了解并上手IOT云服务设备的在线调试操作。

miRanda是什么

2020-11-03 16:31:07

miRanda是一种用于寻找microRNA基因组标靶的算法。该算法有C语言编写,可视作GPL下的开源方法使用。

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