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Minimap2是什么 Minimap2是什么 时间:2020-11-05 10:07:19 简介 Minimap2是一种多功能序列比对程序,可将DNA或mRNA序列与大型参考数据库对齐。 配置流程 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget-y 2)安装Minimap2依赖库和工具。来自:百科10:26:57 简介 Bowtie是一个快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等。它适合的工作是将小序列对比至大基因组上去。它最长能读取1024个碱基的片段。来自:百科
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如何配置StringTie 时间:2020-11-04 17:16:12 简介 StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,e来自:百科来自:云商店
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