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    install-y git git-lfs java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取GATK最新版本源码。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/broadinstitute/gatk.git 3.编译和安装 1)进入GATK目录。
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    install git cmake3 -y 3)安装Lua。 yum install git cmake3 lua lua-devel -y ----结束 2.下载源码 获取lsyncd源码包。 cd /usr/local/src git clone https://github.com/axkibe/lsyncd
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    关于Predixy的更多信息请访问https://github.com/joyieldInc/predixy/blob/master/README_CN.md。 配置安装流程 1.配置编译环境 1)确保部署predixy上的服务器上已安装redis,且redis处于运行状态,检验方法如下:
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    install-y git java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取“VarScan2 v2.4.1”源码包。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/dkoboldt/varscan.git 3.运行和验证 查看jar包执行参数。
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    配置编译环境 安装依赖。 yum install-y git 2.获取源码 获取“randfold”源码包。 cd/usr/local/ git clone https://github.com/eb00/randfold.git 3.编译和安装 1)编译randfold。 cd
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    获取“miniasm”源码包。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/lh3/miniasm 3.编译和安装 编译miniasm cd/usr/local/src/miniasm make 4.运行和验证 查看miniasm的版本信息。 cd/usr/local/src/miniasm
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    install-y git java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取“picard-2.23.0”源码包。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/broadinstitute/picard.git 3.编译和安装 1)进入Picard目录。
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    新建远程仓库。 如果根据您本地代码库选择gitignore,会帮助您将一些非开发文件屏蔽掉而不受Git纳管。 2.将本地仓库初始化成Git仓库。 在您的仓库中打开Git Bash客户端,执行git init命令。 初始化成功,此时当前文件夹已经是本地Git仓库了。 3.绑定云端仓库。 a
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    install 2.获取源码 获取“libmpc-1.1.0”源码包。 cd /usr/local/src wget http://ftp.vim.org/ftp/gnu/mpc/mpc-1.1.0.tar.gz 3.编译和安装 1)解压软件包。 tar -zxvf mpc-1.1.0.tar
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    3)编译安装libfastcommon。 ./make.sh ./make.sh install ----结束 4.运行和验证 直接用源码中自带的test程序进行验证。 cd /usr/local/src/libfastcommon-1.0.38/src/tests make ./test_ini_parser
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    配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y git 2.获取源码 获取“oases”源码包。 cd/usr/local git clone--recursive https://github.com/dzerbino/oases 3.编译和安装 1)修改
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    2)安装Minimap2依赖库和工具。 yum install-y git gcc-c++zlib-y ----结束 2.获取源码 获取“minimap2”源码包。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/lh3/minimap2 3.编译和安装
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