华为云用户手册

  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 smiles_list Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值:0 最大值:5000 initial_dataset_size Integer 初始化数据集的分子数目。当为-1时,表示分子数目未知。 最小值:-1 最大值:100000 binding_sites Array of BindSiteDto objects 靶点列表。 数组长度:0 - 2 weak_constraints Array of WeakConstraintDto objects 弱约束集合。 数组长度:0 - 16 strong_constraints Array of StrongConstraintDto objects 强约束集合。 数组长度:0 - 5 base_model BaseModel object 基模型。 models Array of BasicDrugModel objects 模型列表。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如R CS B在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 BindSiteDto 参数 参数类型 描述 name String 靶点名称,只能设置为target1或者target2。 最小长度:1 最大长度:128 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件 engine String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。 缺省值:POCKET_DOCKING 最小长度:0 最大长度:15 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。 缺省值:true remove_ligand Boolean 去除受体中的配体分子。 缺省值:true add_hydrogen Boolean 增加氢原子。 缺省值:false 表8 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表9 BoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of doubles 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表10 WeakConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct minimize maximize interaction bool Boolean 属性约束类型bool的参数。 range Array of floats 属性约束类型range的参数。 最小值:-9999 最大值:9999 数组长度:2 - 2 struct StructureConstraintParamsDto object 结构约束参数。 quantiles Array of floats 属性约束类型minimize和maximize的参数。 最小值:0.0 最大值:1.0 数组长度:2 - 2 interaction InteractionConstraintDto object 相互作用力约束参数。 表11 StrongConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅强约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct interaction bool Boolean 属性约束类型bool的参数。 range Array of floats 属性约束类型range的参数。 最小值:-9999 最大值:9999 数组长度:2 - 2 struct StructureConstraintParamsDto object 结构约束参数。 interaction InteractionConstraintDto object 相互作用力约束参数。 表12 StructureConstraintParamsDto 参数 参数类型 描述 structs Array of strings 子结构SMILES。 最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction 参数 参数类型 描述 binding_site String 靶点,只支持target1或target2。 最小长度:1 最大长度:128 type String 相互作用力类型:氢键、疏水作用、盐桥、π-π堆积、π-阳离子。 枚举值: hydrogen_bond hydrophobic_action salt_bridge pi_stacking pi_cation amino_acid String 氨基酸。 最小长度:4 最大长度:16 表15 BaseModel 参数 参数类型 描述 id String 基模型id。 缺省值:pangu-drug-model 最小长度:1 最大长度:128 name String 基模型名称。 缺省值:pangu-drug-model 最小长度:1 最大长度:128 表16 BasicDrugModel 参数 参数类型 描述 id String 模型ID。 task_id String 任务ID。 name String 模型名称。 creator String 模型创建者。 type String 模型类型。 value_range ValueRange object 区间上下限,仅回归型存在。 description String 模型描述信息。 表17 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower Float 区间下限,仅回归型存在。 upper Float 区间上限,仅回归型存在。
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/generation/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "ligands" : [ { "name" : "GLY:A:514", "smiles" : "C1CCCCC1", "index" : 0, "file" : { "source" : "RAW", "format" : "PDB", "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END" } }, { "name" : "UNK1", "smiles" : "c1ccccc1", "index" : 0, "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" } } ], "graph" : { "center_id" : "GLY:A:514", "pairs" : [ { "ligand_ids" : [ "GLY:A:514", "DrugBank:UNK1" ] } ] }, "params" : { "num_pre_equilibrium_steps" : 50000, "num_equilibrium_steps" : 500000, "timestep_size" : 0.002, "num_lambda" : 20 }, "job_result" : { "total_count" : 10, "failed_count" : 1 } }
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 add_membrane Boolean 是否加膜处理。 缺省值:false ligands Array of LigandPreviewDto objects 配体列表。 graph FepGraphDto object 路径图。 params FepParamDto object FEP设置参数。 job_result JobResult object 作业结果信息。 part_failed_reason Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 LigandPreviewDto 参数 参数类型 描述 index Integer 配体索引(从0起编号)。 最小值:0 最大值:99 file DrugFile object 配体文件 name String 配体名称,若无名称则自动命名,格式为UNK+索引(从1起编号)。 最小长度:1 最大长度:32 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 表8 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表9 FepGraphDto 参数 参数类型 描述 center_id String 中心配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 pairs Array of SimilarityDto objects 配体对列表。 数组长度:1 - 100 表10 SimilarityDto 参数 参数类型 描述 ligand_ids Array of strings 配体对。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:2 - 2 表11 FepParamDto 参数 参数类型 描述 pre_equilibrium_time Float 预平衡时长,单位ps,范围为0-200,不包含0,默认为100ps。 最小值:0 最大值:200.0 equilibrium_time Float 平衡时长,单位ns,范围为0-10,不包含0,默认为1ns。 最小值:0 最大值:10.0 num_pre_equilibrium_steps Integer 预平衡步数,默认为50000。 最小值:1 最大值:200000 num_equilibrium_steps Integer 平衡步数,默认为500000。 最小值:1 最大值:10000000 timestep_size Float 时间步长,单位ps,取值范围:大于0,小于等于0.005。 最小值:0.001 最大值:0.005 缺省值:0.002 num_lambda Integer lambda个数。 最小值:2 最大值:30 缺省值:20 表12 JobResult 参数 参数类型 描述 total_count Integer 输入总数。 failed_count Integer 失败个数。 sub_tasks_duration Array of floats 子任务运行时长(秒)。 数组长度:1 - 30 表13 FailedReasonRecord 参数 参数类型 描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id。 最小长度:1 最大长度:128
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/studies/{study_id}/jobs/{job_id}/extremum 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 study_id 是 String study_id 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String study作业id 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "maximum" : { "value" : 17, "row_number" : 102, "column_name" : "Mpro", "row_name" : "AZD-5991" }, "minimum" : { "value" : 17, "row_number" : 102, "column_name" : "Mpro", "row_name" : "AZD-5991" } }
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 maximum ExtremumDto object study作业最值信息 minimum ExtremumDto object study作业最值信息 表4 ExtremumDto 参数 参数类型 描述 value Double 最值 row_number Long 最值所在的行数 column_name String 最值所在的列名 row_name String 最值所在的行名
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 dev_user_pool Boolean notebook是否使用专属资源池 has_dev Boolean 是否 集成开发环境 has_drug Boolean 是否部署药物虚拟筛选 has_encryption_button Boolean 是否显示加密按钮 deploy_mode String 医疗智能体 部署模式 enable_cold_archive Boolean 是否支持归档类型存储 public_bucket_path String 医疗智能体公共数据桶https路径
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "dev_user_pool" : false, "has_dev" : false, "has_drug" : false, "has_encryption_button" : false, "deploy_mode" : "basic", "enable_cold_archive" : true, "public_bucket_path" : "https://bucket.obs.cn-north-4.myhuawei.com" }
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 task_id 是 String 任务ID,通过创建任务接口取得。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 status String 任务状态。 result LigandSimilarityGraphTaskResultDto object 配体相似度图任务结果。 表4 LigandSimilarityGraphTaskResultDto 参数 参数类型 描述 pairs Array of LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto objects 配体相似度图任务结果对列表。 数组长度:1 - 100 表5 LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto 参数 参数类型 描述 ligands Array of strings 两个配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:2 - 2 success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity Float 配体对之间的相似度。 最小值:0 最大值:1 reason String 相似度计算失败的理由。 最小长度:1 最大长度:512
  • 响应示例 状态码: 200 查询配体相似性图计算任务成功响应。 { "status" : "finished", "result" : { "pairs" : [ { "success" : true, "ligands" : [ "FXR_74", "ligand" ], "similarity" : 0, "reason" : null } ] } }
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 task_id 是 String 任务ID,通过创建任务接口取得。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应示例 状态码: 200 查询配体文件预览任务成功响应。 { "status" : "finished", "result" : { "count" : 2000, "has_more" : true, "ligands" : [ { "index" : 0, "name" : "UNK1", "success" : true, "smiles" : "CC(=O)N[C@@H](Cc1ccc(CC(=O)O)c(C(=O)O)c1)C(=O)N[C@H]1CCCCN(Cc2ccc(-c3ccccc3)cc2)C1=O", "formula" : "C33H35N3O7", "is_3d" : false, "structure" : { "format" : "PDB", "compressed" : true, "data" : "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" }, "reason" : null }, { "index" : 1, "name" : "UNK2", "success" : true, "smiles" : "COc1ccc(-c2cc(=O)c3c(O)cc(O[C@@H]4O[C@H](CO[C@@H]5O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]5O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4O)cc3o2)cc1O", "formula" : "C28H32O15", "is_3d" : false, "structure" : { "format" : "PDB", "compressed" : true, "data" : "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" }, "reason" : null } ] } }
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptors" : [ { "receptor" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "bounding_box" : { "center" : [ 0, 0, 0 ], "size" : [ 10, 10, 10 ] }, "remove_water" : true, "remove_ion" : false, "remove_ligand" : false } ], "ligands" : [ { "ligand" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "count" : 100 } ], "engine" : "AUTODOCK_VINA", "job_result" : { "total_count" : 10, "failed_count" : 1 }, "cluster_result" : { "method" : "hiq_mc", "output_dir" : "project://bucket/path/to/task/dir/", "status" : "finished", "failed_reasons" : [ { "reason" : "failed reason" }, { "count" : 1 } ] } }
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine String 引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA、SIMILAR_DOCKING。 job_result JobResult object 作业结果信息。 part_failed_reason Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 cluster_result ClusterJobRsp object 聚类结果信息。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 DockingReceptorDto 参数 参数类型 描述 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。 缺省值:true remove_ligand Boolean 去除受体中的配体分子。 缺省值:true add_hydrogen Boolean 增加氢原子。 缺省值:false docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。 缺省值:POCKET_DOCKING 最小长度:0 最大长度:15 reference_file ReferenceLigandFile object 模板配体文件,仅引擎为SIMILAR_DOCKING时提供。 表7 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表8 BoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标。 最小值:-9999999 最大值:99999999 数组长度:3 - 3 size Array of floats 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小。 最小值:2 最大值:500 数组长度:3 - 3 padding Float 填充。 最小值:0 最大值:20 表9 ReferenceLigandFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库) 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI、CSV等,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表10 LigandDto 参数 参数类型 描述 ligand DrugFile object 配体文件。 count Integer 计算个数。 最小值:1 最大值:1000000 表11 DrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表12 JobResult 参数 参数类型 描述 total_count Integer 输入总数。 failed_count Integer 失败个数。 表13 ClusterJobRsp 参数 参数类型 描述 method String 分子聚类方法。 output_dir String 分子聚类输出结果。 status String 作业结果信息。 failed_reasons Array of FailedReasonRecord objects 部分失败原因和数量。 表14 FailedReasonRecord 参数 参数类型 描述 reason String 失败原因。 count Integer 失败数量。
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/docking/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id。 最小长度:1 最大长度:128
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/images/docker-login-cmd 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 data_delete Boolean 项目级删除策略(true:允许项目数据删除操作,false:不允许删除操作,默认为true) data_download Boolean 项目级下载策略(true:允许项目数据下载操作,false:不允许下载操作,默认为true) data_encrypted Boolean 项目级加密策略(true:允许项目 数据加密 操作,false:不允许加密操作,默认为false) data_share Boolean 项目级分享策略(true:允许项目数据拷贝/引用操作,false:不允许拷贝/引用操作,默认为true)
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/policy 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "complete_data" : [ "demo" ], "running_data" : [ "demo" ], "creator" : "creator", "source_project_id" : "fce1376b-72f9-4d15-9f95-9b533cb988ab", "source_project_name" : "source-project", "id" : "94116a6b-1945-4581-b64c-2cea712988ab", "name" : "DataDelete-20210421093037", "sources" : [ "demo" ], "create_time" : "2021-04-21T09:30:37Z", "end_time" : "2021-04-21T09:30:37Z", "status" : "SUCCEED", "destinations" : [ "demo" ], "type" : "DELETE_DATA", "failed_reason" : "failed reason" }
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 complete_data Array of strings 已完成的数据列表 running_data Array of strings 正在执行的数据列表 creator String 数据作业创建者 source_project_id String 非本项目操作场景下源项目名称 source_project_name String 非本项目操作场景下源项目名称 id String 数据作业ID name String 数据作业名称 sources Array of strings 数据列表 create_time String 数据作业创建时间 end_time String 数据作业结束时间 status String 数据作业状态 destinations Array of strings 数据列表 type String 数据作业类型 failed_reason String 数据作业失败原因 additions String 附加信息
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/data-jobs/{data_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 data_job_id 是 String 数据作业id 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 path String 对象全路径(项目名称:/路径) name String 名称 type String 枚举值: FILE FOLDER size Long 大小 缺省值:0 create_time String 创建时间 content String 文件内容 download_url String 下载链接 allowed_operate Boolean 可操作标记 缺省值:true deletable Boolean 可删除标记 缺省值:true
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "path" : "test-project-id:/test.txt", "name" : "db_test1.txt", "type" : "FILE", "size" : 1024, "create_time" : "2021-02-01T14:25:34Z", "download_url" : "https://www.hhh.com/db_test1.txt", "allowed_operate" : true }
  • 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限, 获取Token 接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 X-Need-Content 否 Boolean 返回文件内容 缺省值:false
  • URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/datas/{path} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 path 是 String 对象全路径(项目名称:|路径) 最小长度:1 最大长度:2000 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
  • 响应示例 状态码: 200 OK { "basic_info" : { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-job", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "status" : "FINISHED", "type" : "OPTIMIZATION", "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name", "output_dir" : "job-analysis/job-name", "expect_charge_num" : 1, "real_charge_num" : 1 }, "receptors" : [ { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" } ], "ligands" : [ { "file" : { "source" : "PRIVATE", "url" : "project:/dir/file" }, "count" : 10000 } ] }
  • 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 basic_info DrugJobDto object 作业基本信息。 receptors Array of 表14-14 objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 100 ligands Array of 表14-15 objects 小分子。 数组长度:1 - 1 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 labels Array of strings 作业标签。 status String 作业状态。 type String 作业类型。 create_time String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示,当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。 expect_charge_num Double 预估功能调用消耗次数。 real_charge_num Double 实际功能调用消耗次数。 progress Progress object 作业进度信息。 upstream_job_info String 上游作业信息。 表5 Progress 参数 参数类型 描述 overall Float 整体进度。 estimated_finish_time Long 预计结束时间,毫秒。 表6 ReceptorDrugFile 参数 参数类型 描述 source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000 表7 MoleculeFileDto 参数 参数类型 描述 file 表14-16 object 分子文件。 count Integer 分子个数。 最小值:1 最大值:1000000 表8 MoleculeFile 参数 参数类型 描述 source String 文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1 最大长度:6 data String 文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:0 最大长度:10000000
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